Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam172aQ3TNH5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam172aQ3TNH5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam172aQ3TNH5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam172aQ3TNH5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam172aQ3TNH5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam172aQ3TNH5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam172aQ3TNH5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms