Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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