Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccbe1Q3MI99 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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