Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms