Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms