Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms