Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms