Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MitfQ08874 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms