Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Col9a2Q07643 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms