Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms