Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms