Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col6a1Q04857 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms