Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms