Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms