Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tff2Q03404 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms