Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb5Q02739 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb5Q02739 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms