Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms