Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms