Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb1Q00420 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms