Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms