Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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