Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms