Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ptprn2P80560 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ptprn2P80560 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ptprn2P80560 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms