Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms