Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn1P70268 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms