Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NfixP70257 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfixP70257 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms