Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms