Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf6P70196 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms