Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d2P62838 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms