Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsnl1P62761 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms