Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rps29P62274 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms