Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp46P62069 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms