Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga11P61622 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga11P61622 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms