Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap25P60879 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms