Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms