Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P58686 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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P58686 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms