Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtdsplP58465 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtdsplP58465 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms