Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms