Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn18P56857 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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