Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms