Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr5P51682 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms