Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms