Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms