Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms