Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CratP47934 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CratP47934 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CratP47934 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CratP47934 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms