Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms