Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms