Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms