Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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