Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighmbp2P40694 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighmbp2P40694 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms